【Biomak Res】复旦泰州团队应用Olink技术筛选出食管鳞状细胞癌潜在液体活检蛋白标志物

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期刊: Biomarker Research
影响因子:6.148
发表时间:2021
原文标题:Targeted proteomics-derived biomarker profile develops a multi-protein classifier in liquid biopsies for early detection of esophageal squamous cell carcinoma from a population-based case-control study
发表单位:复旦大学泰州健康科学研究院、山东大学齐鲁医院福建医科大学

 

   
研究背景
 
食管鳞状细胞癌 (ESCC) 是食管癌的主要组织学亚型,尤其是在亚洲和东非。据国际癌症研究机构估计,2018年全球有572,034例新发食管癌病例和508,585例食管癌死亡病例,大多数国家的死亡率与发病率之比超过0.8。食管癌的5年总生存率仅为15%至25%,因为大多数患者被诊断时已经为晚期,预后通常不佳。经济高效快速基于血液的液体活检技术是食管癌风险分层的理想解决方案,以便确定真正需要内窥镜检查的高危人群。

目前,科研界已经探索了各种血液生物标志物,包括游离DNA、游离RNA、非编码RNA、蛋白质等的突变和甲基化状态,并通过不同的检测平台实现多种癌症类型的早期检测。然而,迄今为止,在临床应用中可用于筛查早期 ESCC 的有效生物标志物很少,因为大多数潜在生物标志物的AUC通常低于80%。

Olink邻近延伸分析 (PEA)创新性地将抗体的特异性与聚合酶链反应 (PCR) 的灵敏度相结合,允许仅使用微升级的血清即可以可靠的测定精度同时检测高达上千种蛋白生物标志物,从而能够快速筛选针对ESCC的潜在生物标志物。这一技术突破有助于实现“多组学水平的液体活检/肿瘤早筛”。

 

本文摘要

复旦大学泰州健康科学研究院金力院士、陈兴栋教授团队,与山东大学齐鲁医院吕明教授团队、福建医科大学叶为民副校长团队,应用Olink PEA技术检测了中国泰州地区300例ESCC前瞻性设计病例对照研究血清样本(70名健康对照者、30名癌前患者、60名I期患者、70名II期患者和70名III/IV期ESCC患者)中的92种癌症相关蛋白的水平(Olink Oncology II试剂盒),以期找到ESCC早期诊断候选血清蛋白生物标志物。

此研究发现血清中10个上调和13个下调的蛋白质生物标志物可以区分早期 ESCC与健康对照,并通过与ESCC病理进展显著剂量反应关系得到验证。

应用最小绝对收缩和选择算子 (LASSO) 回归和后向消除算法,最终从这23个蛋白中优选出ANXA1(annexin A1)、hK8(kallikrein-8)、hK14(kallikrein-14)、VIM(vimentin) 和RSPO3(R-spondin-3)保留在最终模型中以区分早期 ESCC 病例与健康对照,曲线下面积 (AUC)可达0.936。

 

通过五重交叉验证,该5种蛋白组成的诊断模型在训练和测试数据集中的平均准确率分别达到0.861和0.825。因此,该模型可被视为筛查和早期诊断ESCC的潜在工具。

 

 

选定的多种蛋白标志物图谱的操作特征 (ROC) 曲线。红线由11个蛋白标志物模型拟合,即ANXA1、hK8、CDKN1A、MetAP2、hK14、VIM、GPC1、RSPO3、TRAIL、5NT、SEZ6L。黑线由优选后的5个蛋白标志物模型拟合,即 ANXA1、hK8、hK14、VIM 和 RSPO3。使用逻辑回归建立诊断模型

 

 

参考文献:

Yang et al. Biomarker Research (2021) 9:12 https://doi.org/10.1186/s40364-021-00266-z


 

2021年11月17日 11:09
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